大多數網站設計，只考慮正常用戶穩定使用。但在黑客對漏洞敏銳的發覺和充分利用的動力下，網站存在的這些漏洞就被挖掘出來，且成為黑客們直接或間接獲取利益的機會。對于Web應用程序的SQL注入漏洞，有試驗表明，通過搜尋1000個網站取樣測試，檢測到有15%的網站存在sql注入漏洞。
1、網站防御措施過于落后，甚至沒有真正的防御
大多數防御傳統的基于特征識別的入侵防御技術或內容過濾技術，對保護網站抵御黑客攻擊的效果不*。比如對SQL注入、跨站腳本這種特征不*一的網站攻擊，基于特征匹配技術防御攻擊，不能精確阻斷攻擊。因為黑客們可以通過構建任意表達式來繞過防御設備固化的特征庫，比如：and 1=1 和 and 2=2是一類數據庫語句，但可以人為任意構造數字構成同類語句的不同特征。而and、=等這些標識在WEB提交數據庫應用中又是普遍存在的表達符號，不能作為攻擊的*一特征。因此，這就很難基于特征標識來構建一個精確阻斷SQL注入攻擊的防御系統。導致目 前有很多黑客將sql注入成為入侵網站的**攻擊技術之一?；趹脤訕嫿ǖ墓?，防火墻更是束手無策。
網站防御不*還有另一個原因，有很多網站管理員對網站的價值認識僅僅是一臺服務器或者是網站的建設成本，為了這個服務器而增加超出其成本的安全防護措施認為得不償失。而實際網站遭受攻擊之后，帶來的間接損失往往不能用一個服務器或者是網站建設成本來衡量，很多信息資產在遭受攻擊之后造成無形價值的流失。不幸的是，很多網站負責的單位、人員，只有在網站遭受攻擊后，造成的損失遠超過網站本身造價之后才意識就這一點。
2、黑客入侵后，未被及時發現
有些黑客通過篡改網頁來傳播一些非法信息或炫耀自己的水平，但篡改網頁之前，黑客肯定基于對漏洞的利用，獲得了網站控制權限。這不是*可怕的，因為黑客在獲取權限后沒有想要隱蔽自己，反而是通過篡改網頁暴露自己，這雖然對網站造成很多負面影響，但黑客本身未獲得直接利益。更可怕的是，黑客在獲取網站的控制權限之后，并不暴露自己，而是利用所控制網站產生直接利益;網頁掛馬就是一種利用網站，將瀏覽網站的人種植其木馬的一種非常隱蔽且直接獲取利益的主要方式之一。訪問網站而被種植木馬的人通常也不知情，導致一些用戶的機密信被竊取。網站成了黑客散布木馬的一個渠道。網站本身雖然能夠提供正常服務，但訪問網站的人卻遭受著木馬程序的危害。這種方式下，黑客們通常不會暴露自己，反而會盡量隱蔽，正好比暗箭難防，所以很多網站被掛木馬數月仍然未被察覺。由于掛馬原理是木馬本身并非在網站本地，而是通過網頁中加載一個能夠讓瀏覽者自動建立另外的下載連接完成木馬下載，而這一切動作是可以很隱蔽的完成，各個用戶不可見，因此這種情況下網站本地的病毒軟件也無法發現這個掛馬實體。
3、發現安全問題不能徹底解決
網站技術發展較快、安全問題日益突出，但由于關注重點不同，絕大多數的網站開發與設計公司，網站安全代碼設計方面了解甚少，發現網站安全存在問題和漏洞，其修補方式只能停留在頁面修復，很難針對網站具體的漏洞原理對源代碼進行改造。這些也是為什么有些網站安裝網頁防止篡改、網站恢復軟件后仍然遭受攻擊。我們在一次網站安全檢查過程中，曾經戲劇化的發現，網站的網頁防篡改系統將早期植入的惡意代碼也保護了起來。這說明很少有人能夠準確的了解網站安全漏洞解決的問題是否徹底。
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